民用无人驾驶航空器运营合格证和无人机企业经营许可证是无人机合法运营的重要证件。以下是办理这两个证件的一般步骤：

了解相关法规和标准：在办理前，需要了解国家及地区关于无人机运营的法律法规、飞行安全标准和管理规定。

准备申请材料：通常包括企业法人营业执照、税务登记证、组织机构代码证等相关资质证明；无人机飞行人员的资质证明；无人机的技术规格和性能参数；安全管理制度和应急预案等。

提交申请材料并接受审核：将准备好的申请材料提交给相关管理部门进行审核。审核过程可能包括对材料的真实性、完整性进行核实，以及对安全管理制度和应急预案的评估。

获得运营合格证和经营许可证：如果申请材料符合要求，且安全管理制度和应急预案得到认可，管理部门将颁发运营合格证和经营许可证。

需要注意的是，具体的办理流程和要求可能因地区和行业而有所不同。建议你在办理前详细咨询当地的民航管理部门或相关专业机构，以确保办理过程顺利。同时，持有相关证件后，还需遵守法规，确保无人机运营的安全和合法。