办理民用无人驾驶航空器运营合格证需要准备的资料可能因地区和具体情况而有所不同，一般包括以下材料：

身份证明：申请人的有效身份证明材料，如身份证、护照等。

无人机注册证明：提供无人机的注册证明文件。

飞行保险凭证：需提供符合民用航空器飞行保险要求的保险凭证。

营业执照：如果是企业用户，需要提供有效的企业营业执照。

其他相关证明材料：根据不同的运营用途，可能需要提供其他相关证明材料，例如无人机经营许可授权书、场地证明等。